En la actualidad, Japón se encuentra en guerra. Aunque de momento, las consecuencias de esta no parecen hacerse notar en Hokkaido, todo el mundo teme que en algún momento comiencen los ataques.
En este ambiente de incertidumbre, se desarrolla la historia de Shûji y Chise, dos jovenes estudiantes de instituto, que acaban de comenzar a salir juntos, tras un gran esfuerzo de ella, tímida y torpe por naturaleza. Sin embargo, su amor se debe enfrentar a, quizá, la prueba más dura a la que nadie se haya visto sometido jamás: sin saber bien como ni porqué, Chise es seleccionada para un experimento militar; se acaba de convertir en "El Arma Definitiva", la última esperanza de Japón para salir airoso de la contienda.